Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRATP43155 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRATP43155 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRATP43155 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRATP43155 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRATP43155 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRATP43155 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms