Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTTP42858 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTTP42858 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTTP42858 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTTP42858 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTTP42858 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTTP42858 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HTTP42858 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTTP42858 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTTP42858 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTTP42858 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTTP42858 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTTP42858 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms