Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACAA2P42765 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ACAA2P42765 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms