Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms