Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDH1P40925 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MDH1P40925 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MDH1P40925 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDH1P40925 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDH1P40925 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDH1P40925 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDH1P40925 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDH1P40925 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDH1P40925 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDH1P40925 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDH1P40925 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms