Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PBX1P40424 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PBX1P40424 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PBX1P40424 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PBX1P40424 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PBX1P40424 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PBX1P40424 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX1P40424 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX1P40424 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX1P40424 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PBX1P40424 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PBX1P40424 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms