Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 SAM37YMR060C 984 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YIM2YMR151W 438 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RRG9YNL213C 645 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 MCM16YPR046W 546 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 FES1YBR101C 873 nt2.37□□□□□ -2.03
CCS1P40202 MDV1YJL112W 2145 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 PUF6YDR496C 1971 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 PFF1YBR074W 2931 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SEC7YDR170C 6030 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 CDC20YGL116W 1833 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RTT10YPL183C 3042 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 NKP1YDR383C 717 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 WBP1YEL002C 1293 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ERP6YGL002W 651 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YIL174WYIL174W 228 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YJL028WYJL028W 336 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YKL177WYKL177W 339 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 MTR2YKL186C 555 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 MSM1YGR171C 1728 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 KRE2YDR483W 1329 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SRO9YCL037C 1305 nt2.36□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YVC1YOR087W 2028 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YFL040WYFL040W 1623 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 CUE3YGL110C 1875 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RKM4YDR257C 1485 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ARG2YJL071W 1725 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 PNC1YGL037C 651 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YLR012CYLR012C 300 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 APC9YLR102C 798 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YAR069CYAR069C 294 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YLR402WYLR402W 192 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YMR087WYMR087W 855 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RAX2YLR084C 3663 nt2.35□□□□□ -2.03
CCS1P40202 UBP8YMR223W 1416 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ADY4YLR227C 1482 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 ESL1YIL151C 3357 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 CLB3YDL155W 1284 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 RPC11YDR045C 333 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YIL086CYIL086C 309 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SDP1YIL113W 630 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SWD2YKL018W 990 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 TDA8YAL064C-A 381 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 YLR326WYLR326W 723 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 SSN8YNL025C 972 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 USV1YPL230W 1176 nt2.34□□□□□ -2.03
CCS1P40202 CUS1YMR240C 1311 nt2.34□□□□□ -2.04
CCS1P40202 NDC80YIL144W 2076 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 JSN1YJR091C 3276 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 DSL1YNL258C 2265 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 TGL1YKL140W 1647 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 PDS1YDR113C 1122 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 RPL14BYHL001W 417 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 RPS22AYJL190C 393 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 CPR7YJR032W 1182 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 ATP25YMR098C 1839 nt2.33□□□□□ -2.04
CCS1P40202 TPD3YAL016W 1908 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 CDC55YGL190C 1581 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 GRX6YDL010W 696 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 RDI1YDL135C 609 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YDR193WYDR193W 399 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 CFD1YIL003W 882 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 PET130YJL023C 1044 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YJR128WYJR128W 360 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 ATG3YNR007C 933 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 TAF14YPL129W 735 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 PRE2YPR103W 864 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 SEC26YDR238C 2922 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 RPO41YFL036W 4056 nt2.32□□□□□ -2.04
CCS1P40202 AXL1YPR122W 3627 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 RPS29BYDL061C 171 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 GLG2YJL137C 1143 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YUH1YJR099W 711 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 BUR2YLR226W 1188 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 HPA2YPR193C 471 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YPR203WYPR203W 309 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YBR242WYBR242W 717 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 KIN82YCR091W 2163 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 NFI1YOR156C 2181 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YGR237CYGR237C 2358 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 ORC1YML065W 2745 nt2.31□□□□□ -2.04
CCS1P40202 VAS1YGR094W 3315 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 SAP1YER047C 2694 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 GIN4YDR507C 3429 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 ARC15YIL062C 465 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YLR339CYLR339C 552 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YML037CYML037C 1023 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YOR314WYOR314W 330 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 SKT5YBL061C 2091 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 ESC1YMR219W 4977 nt2.3□□□□□ -2.04
CCS1P40202 BUD30YDL151C 582 nt2.29□□□□□ -2.04
CCS1P40202 RPL27AYHR010W 411 nt2.29□□□□□ -2.04
CCS1P40202 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.29□□□□□ -2.04
CCS1P40202 MTD1YKR080W 963 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms