Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA9P38646 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms