Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2IP36954 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2IP36954 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms