Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBRP36941 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBRP36941 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBRP36941 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBRP36941 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms