Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKAP35790 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHKAP35790 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHKAP35790 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHKAP35790 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHKAP35790 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKAP35790 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKAP35790 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKAP35790 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKAP35790 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKAP35790 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms