Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA3P35244 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA3P35244 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPA3P35244 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms