Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRS3P32247 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRS3P32247 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRS3P32247 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRS3P32247 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRS3P32247 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRS3P32247 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRS3P32247 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms