Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms