Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms