Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms