Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBL1P28749 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBL1P28749 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBL1P28749 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBL1P28749 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBL1P28749 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBL1P28749 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBL1P28749 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBL1P28749 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBL1P28749 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms