Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMB4P28070 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB4P28070 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms