Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA2P25787 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA2P25787 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA2P25787 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA2P25787 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA2P25787 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA2P25787 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms