Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTAFRP25105 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTAFRP25105 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms