Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRGP23470 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRGP23470 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
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