Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USF1P22415 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USF1P22415 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USF1P22415 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USF1P22415 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USF1P22415 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USF1P22415 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USF1P22415 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF1P22415 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms