Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD247P20963 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD247P20963 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD247P20963 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD247P20963 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD247P20963 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD247P20963 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD247P20963 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD247P20963 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms