Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDSP20132 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDSP20132 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDSP20132 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDSP20132 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDSP20132 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SDSP20132 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDSP20132 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSP20132 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSP20132 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSP20132 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms