Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT15P19012 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT15P19012 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT15P19012 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT15P19012 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT15P19012 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms