Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms