Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYN1P17600 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYN1P17600 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYN1P17600 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYN1P17600 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYN1P17600 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms