Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL3L1P16619 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms