Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPCAMP16422 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms