Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME1P15531 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME1P15531 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME1P15531 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME1P15531 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME1P15531 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME1P15531 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME1P15531 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME1P15531 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME1P15531 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms