Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA1P15085 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA1P15085 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CPA1P15085 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA1P15085 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA1P15085 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA1P15085 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA1P15085 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA1P15085 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA1P15085 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA1P15085 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms