Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2AP11388 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms