Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYGBP11216 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYGBP11216 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYGBP11216 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYGBP11216 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1014.6 ms