Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAMP11215 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms