Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARAP10276 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARAP10276 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARAP10276 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARAP10276 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARAP10276 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARAP10276 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms