Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI4P10075 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI4P10075 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI4P10075 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI4P10075 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI4P10075 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI4P10075 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI4P10075 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI4P10075 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms