Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETSIPP0DME0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms