Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD2P0DJD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms