Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms