Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2MP0CAP2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms