Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4AP0C0L4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4AP0C0L4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms