Protein–RNA interactions for Protein: P08709

F7, Coagulation factor VII, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F7P08709 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F7P08709 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F7P08709 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
F7P08709 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F7P08709 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F7P08709 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F7P08709 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F7P08709 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
F7P08709 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F7P08709 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F7P08709 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F7P08709 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms