Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCP02774 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GCP02774 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCP02774 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GCP02774 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCP02774 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCP02774 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCP02774 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCP02774 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCP02774 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCP02774 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCP02774 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCP02774 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCP02774 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCP02774 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GCP02774 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCP02774 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCP02774 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCP02774 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCP02774 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms