Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOEP02649 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOEP02649 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOEP02649 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOEP02649 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOEP02649 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms