Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NSD2O96028 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NSD2O96028 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSD2O96028 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSD2O96028 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSD2O96028 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSD2O96028 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSD2O96028 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSD2O96028 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSD2O96028 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NSD2O96028 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NSD2O96028 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NSD2O96028 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NSD2O96028 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms