Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA3O96018 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA3O96018 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBA3O96018 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APBA3O96018 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBA3O96018 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APBA3O96018 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA3O96018 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA3O96018 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA3O96018 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA3O96018 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA3O96018 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBA3O96018 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APBA3O96018 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms