Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms