Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMFO60524 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEMFO60524 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMFO60524 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMFO60524 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms