Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM44O43615 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms