Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBFA2T2O43439 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBFA2T2O43439 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBFA2T2O43439 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms